由于RO膜可以脱除溶解性的离子而不能脱除溶解性的气体，RO产水中的CO2含量与RO进水中CO2的含量基本相同，但是HCO3－和CO32-常常能够减少1～2个数量级，这样就会打破进水中CO2、HCO3－和CO32-之间的平衡，在系列反应中，CO2将与H2O结合发生如下反应平衡的转移，直到建立新的平衡。
如果进水中含有CO2，则RO的产水pH值总会降低，对于大多数RO系统反渗透产水的pH值将有1～2个pH值的下降，当进水碱度和HCO3－高时，产水的pH值下降就更大。

为数极少的进水，含较少的CO2、HCO3－或CO32-这样看到产水pH值的变化就少，某些国家和地区，对于饮用水pH值有规定，一般为6.5～9.0，根据我们的理解，这是为了防止输水管路的腐蚀，而饮用低pH值的水，本身不会引起任何健康问题，众所周知，许多市售含碳酸饮料其pH值在2～4之间。
HCO3－ CO2 + H2O+ H+